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植物small RNA靶基因预测软件,psRobot

psRoto软件安装

  1. 网址
http://omicslab.genetics.ac.cn/psRobot/downloads.php
  1. 下载和安装
wget http://omicslab.genetics.ac.cn/psRobot/program/WebServer/psRobot_v1.2.tar.gz
#
tar -zxvf psRobot_v1.2.tar.gz
#
cd psRobot_v1.2
##
./configure
make 
make install

psRoto中的4个程序

  1. psRobot_map

psRobot_map 用于在较长的参考序列中找到短序列(小于 40bp)的所有完美匹配位置;

  1. psRobot_mir

psRobot_mir旨在从高通量测序数据中为一批输入序列寻找具有茎环前体的小RNA(如miRNA或shRNA)

  1. psRobot_tar

psRobot_tar 用于寻找潜在的小 RNA 靶标

  1. psRobot_deg

psRobot_deg 用于识别用户指定的退化组数据支持哪些小 RNA 靶点


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  • WGCNA分析代码六

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2. 精美图形绘制教程

  • 精美图形绘制教程
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3. 转录组分析教程

  • 转录组上游分析教程[零基础]

  • 一个转录组上游分析流程 | Hisat2-Stringtie

  • Samll RNA上游分析

4. 转录组下游分析

  • 批量做差异分析及图形绘制 | 基于DESeq2差异分析

  • GO和KEGG富集分析

  • 单基因GSEA富集分析

  • 全基因集GSEA富集分析

BioinfoR生信筆記 ,注于分享生物信息学相关知识和R语言绘图教程。

http://www.lryc.cn/news/578315.html

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