Defects4j数据集安装及使用
0、常见问题
1. 所有配置完成后运行defects4j info -p Lang测试出现错误
Can't locate DBI.pm in @INC (you may need to install the DBI module) (@INC contains: /myproject/defects4j/framework/lib /myproject/defects4j/framework /myproject/defects4j/framework/core /myproject/defects4j/framework/core /etc/perl /usr/local/lib/x86_64-linux-gnu/perl/5.34.0 /usr/local/share/perl/5.34.0 /usr/lib/x86_64-linux-gnu/perl5/5.34 /usr/share/perl5 /usr/lib/x86_64-linux-gnu/perl-base /usr/lib/x86_64-linux-gnu/perl/5.34 /usr/share/perl/5.34 /usr/local/lib/site_perl) at /myproject/defects4j/framework/core/DB.pm line 43.
BEGIN failed--compilation aborted at /myproject/defects4j/framework/core/DB.pm line 43.
Compilation failed in require at /myproject/defects4j/framework/core/Mutation.pm line 41.
BEGIN failed--compilation aborted at /myproject/defects4j/framework/core/Mutation.pm line 41.
Compilation failed in require at /myproject/defects4j/framework/core/Project.pm line 103.
BEGIN failed--compilation aborted at /myproject/defects4j/framework/core/Project.pm line 103.
Compilation failed in require at /myproject/defects4j/framework/bin/d4j/d4j-info line 58.
BEGIN failed--compilation aborted at /myproject/defects4j/framework/bin/d4j/d4j-info line 58.
Compilation failed in require at /myproject/defects4j/framework/bin/defects4j line 155.
# 一、Defects4j数据集安装
**`在Ubuntu系统上进行操作`**，具体的在：[Defects4j数据集安装](https://blog.csdn.net/weixin_46439193/article/details/104721218)
解决方法：
sudo apt-get install libdbi-perl
二、Defects4j数据集的使用
1. 常用命令
Getting started
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#### Setting up Defects4J
1. Clone Defects4J:- `git clone https://github.com/rjust/defects4j`2. Initialize Defects4J (download the project repositories and external libraries, which are not included in the git repository for size purposes and to avoid redundancies):- `cd defects4j`- `./init.sh`3. Add Defects4J's executables to your PATH:- `export PATH=$PATH:"path2defects4j"/framework/bin`#### Using Defects4J
4. Check installation and get information for a specific project (commons lang):- `defects4j info -p Lang`- `defects4j info -p Math`5. Get information for a specific bug (commons lang, bug 1):- `defects4j info -p Lang -b 1`6. Checkout a buggy source code version (commons lang, bug 1, buggy version):- `defects4j checkout -p Lang -v 1b -w /tmp/lang_1_buggy`7. Change to the working directory, compile sources and tests, and run tests:- `cd /tmp/lang_1_buggy`- `defects4j compile`- `defects4j test`8. More examples of how to use the framework are available in `framework/test`2. 框架
defects4j||--- project_repos: The version control repositories of the provided projects.||--- major: The Major mutation framework.||--- framework: Libraries and executables of the database abstraction and| test execution framework.||--- bin: Command line interface to Defects4J.||--- core: The modules of the core framework.||--- lib: Libraries used in the core framework.||--- util: Util scripts used by Defects4J.||--- projects: Project-specific resource files.||--- test: Scripts to test the framework.
首先看一下文件结构，首先是project_repos,指提供的含有故障的项目的版本控制库，之后是major,是主要的变异框架，再framework中存在我们比较需要的各种信息，重点关注projects，里面是各种真实故障的项目。
以Lang为例，讲解一下里面的目录结构
Lang
逻辑是这样的，对每个defects4j项目来有很多测试类，每个测试类里面有很多测试用例，如果全通过了就说明程序没有问题，但有些情况下测试可能不通过，可能只是某一两个测试方法不通过，难道要把所有的程序再重新加载，进行实验吗？西门子故障程序是那么做的，不同版本的故障程序之间只有一两行不一样，所有的测试用例也都是一样的，测试用例对在运行不同版本的故障程序时结果是不同的。这种情况在defects4j上行不通，因为西门子程序太小了，这里动辄上万行的代码。
- trigger tests
每个故障版本都对应个一个trigger test，这个trigger test里面包含了一些引发了程序bug的测试方法。
-
modified classes
既然有了trigger test ，那么就必然有bug，那么文件夹modified_classes里面装的就是将bug修复时，需要改动源程序中的哪些类。
如图，Lang项目的第一个故障版本需要改动NumberUtils类即可修复。 -
loaded classes/relevant classes
虽然bug只和这一个类有关，但程序是一个整体，只有这一个类跑不起来呀，想要跑起来需要很多relevant classes,在项目里是loaded_classes文件夹下，只有将这些类都加载进JVM中，trigger test方法才能跑起来。 -
relevant tests
既然trigger test的运行，说明了程序中存在bug，只是在trigger_test中引发了bug,其他的测试程序中可能也跑了故障代码（modified classes），但是没有引发故障，所以relevent tests里面记录的就是所有的相关测试类。所谓相关测试类就是指当执行测试方法时，JVM中加载了modified classes,这样就保证了所有相关的测试都包含在内。 -
patches
最后就是patches,其中src.patch记录了故障应该怎么修复，比如说，按照github的教程上执行了
defects4j checkout -p Lang -v 1b -w /tmp/lang_1_buggy
这行代码后，实际上就是在/tmp/lang_1_buggy文件夹下将这个Lang 1 版本编译，测试所需要所有类和测试类都写进去了，在src文件夹下，我们再执行
cd /tmp/lang_1_buggy
defects4j compile
defects4j test
注意，这里可以直接在linux中使用命令进行编译和测试，如果想在IDEA中进行运行测试，我这里用的环境是jdk1.7和maven3.8.1，注意：亲测maven3.6不行
这时候我们编译的是含有故障的代码，运行后
它就会显示trigger test中记录的故障代号。
如果我们想要一个没有故障的版本怎么办呢，就对defects4j checkout后，/tmp/lang_1_buggy中的源码进行更改即可，按照src.patch更改源码，其中@@后是代码在NumberUtils.java中的行数，每行代码前面没有符号时，代表代码无需改动，- 代表是新加的正确代码，+ 代表是错误代码，注释掉即可。
更改完代码后，我们再执行defexts4j test 就没有错误了。
这种方法可以帮助我们获取无故障的源码，以及为程序中插入故障提供思路。