WSI中sdpc格式文件学习

一、环境安装

这里使用的是sdpc包。一开始使用opensdpc包，配置环境时一直报错.....

pip install sdpc-for-pythonconda install -c conda-forge ffmpeg=4.3

二、基础操作

• 导入sdpc 库

import sdpc

• 查看 WSI

wsi = sdpc.Sdpc(wsi_path)

• 获取WSI的level

level_count = wsi.level_count

• 获取WSI每个level的像素值

level_dimensions = wsi.level_dimensions

• 在 WSI 中获取某个级别某个位置下的补丁

img = wsi.read_region((Position_X, Position_Y), patch_level, (size_H, size_W))   # patch_size = (size_H, size_W)

• 的

参考

python转换sdpc格式到图片-CSDN博客https://blog.csdn.net/z2498249/article/details/136137947histopathology/sdpc-for-python：用于处理 sdpc 格式的全玻片图像 （WSI） 的 Python 库https://github.com/histopathology/sdpc-for-python