R 语言科研绘图第 64 期 --- 哑铃图
在发表科研论文的过程中,科研绘图是必不可少的,一张好看的图形会是文章很大的加分项。
为了便于使用,本系列文章介绍的所有绘图都已收录到了 sciRplot 项目中,获取方式:
R 语言科研绘图模板 --- sciRplothttps://mp.weixin.qq.com/s/QA_8LVqjkdg4A16zLonw4w?payreadticket=HFLOAncGRDz6yRsCTNzc-Kcm3G1KwIbFQ7EvHuhwg_HxWTCq_umJlitFrq5vaHBVSx0N6-o
本期绘图预览:
1. 导入包
我们首先导入本期绘图用到的 R 包:
library(ggplot2)
2. 准备数据
接下来我们导入绘图用到的数据,在 sciRplot 中给大家提供了测试数据:
data <- sciRplot_data
查看下数据格式:
3. 准备配色
颜色的选择往往是一件让人特别纠结的事情,这里我们直接使用 sciRcolor 来设置配色:
colors <- sciRcolor::pal_scircolor(37)[1:2]
sciRcolor 是为了 R 语言科研绘图开发的配色工具,包含了 100 种常用配色,详细信息见:
R 语言科研配色工具 --- sciRcolorhttps://mp.weixin.qq.com/s/XZol4VxvHnJD_49ij3f2mg?payreadticket=HLlkm7ZxA2IS8TE108ehxgrBVVdQR74HBdZEk1Oqe3VfQFVKUqQ7AqabZ96nf8z6rWSyqd0
4. 绘制图形
接下来我们通过下面的代码来绘制图形:
p <-
ggplot(data, aes(x=x,y=y)) +
geom_segment(aes(x=x, xend=x, y=y1, yend=y2), color="#C9CACA", size=3) +
geom_point(aes(x=x, y=y1), color=colors[1], size=10) +
geom_point(aes(x=x, y=y2), color=colors[2], size=10) +
labs(x="X", y="Y", title="") +
scale_y_continuous(breaks=seq(0,50,10), limits = c(0,50),
expand = expansion(mult = c(0, 0.05))) +
theme_classic(base_size = 25) +
theme(panel.grid.major.y = element_line())
p
5. 保存图形
最后我们保存绘制的图形:
ggsave("save/dumbbell-plot.png", p, width = 8, height = 6, dpi = 300)
sciRplot 介绍
为了解决 R 语言中科研绘图的问题,我推出了 sciRplot 项目。sciRplot 项目包含了以下内容:
① 100 种绘图代码,按照图形类型进行分类,包含 60 种基础绘图和 40 种进阶绘图
② 配备一站式 html文档,包含测试数据,代码一键复制,交互式阅读提高用户体验