mamba的安装及下载速度慢问题解决
同事反馈mamba的安装时网络慢
mamba是conda的加速工具,相比于conda 对包和环境的管理,mamba可以实现并行运算。相比于 conda,mamba 是用C++重写了 conda 的部分功能,运行效率显著提高,可以进行并行的下载,使用管理工具中的 libsolv,可以更快的解决环境依赖问题。mamba 的使用也比较简单,首先使用 conda 安装 mamba,后面所有用到 conda 的地方,都可以使用 mamba 替换即可。
下载安装miniconda
wget https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
chmod +x Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh #给下载下来的安装文件添加执行权限
sudo bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
配置环境,vi ~/.bashrc 在最后添加下面内容
# >>> conda initialize >>>
# !! Contents within this block are managed by 'conda init' !!
__conda_setup="$('/root/miniconda3/bin/conda' 'shell.bash' 'hook' 2> /dev/null)"
if [ $? -eq 0 ]; theneval "$__conda_setup"
elseif [ -f "/root/miniconda3/etc/profile.d/conda.sh" ]; then. "/root/miniconda3/etc/profile.d/conda.sh"elseexport PATH="/root/miniconda3/bin:$PATH"fi
fi
unset __conda_setup
# <<< conda initialize <<<
运行source ~/.bashrc 使配置生效
更新conda
conda update -n base conda
安装并设置新的求解器(好像不用装也行)
conda install -n base conda-libmamba-solver
conda config --set solver libmamba
安装mamba
conda install mamba -n base -c conda-forge
看到确实下载比较慢,使用命令查看网络连接
netstat -antlp | grep python
在防火墙配置把相关ip调整到其它互联网出口,看到下载速度上来了,可能5-10MB/s
也可通过修改conda源来提供下载速度。 cat .condarc
channels:- https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/- https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/- https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/main/- https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/r/show_channel_urls: truedefault_channels:- https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/main- https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/r- https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/msys2custom_channels:conda-forge: https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloudmsys2: https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloudbioconda: https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloudmenpo: https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloudpytorch: https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloudsimpleitk: https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud