iPHoP：病毒宿主预测

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安装 

conda create -c conda-forge -n iphop_env python = 3 .8 mamba 
conda activate iphop_env 
mamba install -c conda-forge -c bioconda iphop
iphop -h

下载数据库 

iphop download --db_dir path_to_iPHoP_db
#解压
iphop download --db_dir path_to_iPHoP_db --full_verify

使用

iphop predict --fa_file ${i} --num_threads 180 --db_dir /home/zhongpei/hard_disk_sda2/zhongpei/database/iPHop/Aug_2023_pub_rw/ --out_dir ${num}_iPHoP