【数据分析】基于adonis2与pairwise.adonis2的群组差异分析教程
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文章目录
- 介绍
- 加载R包
- 数据下载
- 导入数据
- 数据预处理
- adonis分析
- pairwise.adonis2分析
- 总结
- 系统信息
介绍
本教程主要用于执行和分析基于距离矩阵的多样性和群落结构分析，特别是通过adonis2和pairwise.adonis2函数来评估不同群组间的差异。代码分为几个主要部分：数据准备、ADONIS分析、结果输出。
数据准备
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数据导入：从本地文件中导入距离矩阵（
distance.xls）和元数据（group.xls）。距离矩阵用于表示样本之间的相似性或差异性，元数据包含样本的分组信息。 -
数据预处理：将元数据中的分组信息转换为因子类型，并确保其水平是唯一的。然后，根据元数据中的样本顺序调整距离矩阵的行和列，以确保它们与元数据一致。
ADONIS分析