【科研绘图系列】R语言绘制GO term 富集分析图（enrichment barplot）
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文章目录
- 介绍
- 加载R包
- 数据下载
- 导入数据
- 数据预处理
- 画图
- code 2
- code 3
- 系统信息
介绍
本文介绍了使用R语言绘制GO富集分析条形图的方法。通过加载ggplot2等R包，对GO term数据进行预处理，包括p值转换、文本截断和排序筛选。文章提供了两个代码示例，分别针对不同数据集（dataC.xlsx和dataD.xlsx）进行分析，均采用分组（BP/CC/MF）展示前10个显著GO term。通过自定义绘图函数调整柱状图高度、坐标轴刻度和颜色方案，并使用patchwork包将三个子图合并为整体可视化结果。最终生成的图像清晰展示了不同GO类别中富集项的显著性水平，为生物信息学分析提供了直观的图形呈现。
加载R包
library(readxl)
library(stringr